●1917年（大正6年）
前身の運動部から正式に野球部として発足。
●1925年（大正14年）
國學院大學、専修大学、日本大学、東洋大学、東京商科大学（現一橋大学）、宗教大学（現大正大学）で東京新大学野球部連盟（旧連盟）を結成。國學院大學が優勝。※東京六大学野球連盟は同年秋に結成。
●1929年（昭和4年）
野球部約20名が、当時では珍しい満州・朝鮮への海外遠征を行う。
●1931年（昭和6年）春
國學院大學、専修大学、日本大学、東京大学、中央大学で五大学野球連盟（現東都大学野球連盟）を創立。五大学野球連盟設立以前に、國學院大學は日本大学等と東京六大学野球連盟へ加盟申請を度々行っていた。当時の関東の大学野球で東京六大学各校に準じる実力を持っていた大学は、國學院大學と日本大学の二校であったという説がある。
●1931年（昭和6年）
秋季リーグ戦において、國學院大學と日本大学は６試合６勝０敗勝ち点３で並び、両校同率で優勝預かりとなる。（球場難のために、國學院大學と日本大学の直接対決が行えなかったため）
●1935年（昭和10年）
國學院大學、専修大学、日本大学、中央大学、東京商科大学で東都大学野球連盟を創立。
●2010年（平成22年）
秋季リーグ戦において一部リーグ戦初優勝を飾る。
●2021年（令和3年）
春季リーグ戦において一部リーグ戦2度目の優勝を飾る。
秋季リーグ戦において一部リーグ戦3度目の優勝を飾る。また同時に本学初となる春秋連覇も達成。
2022年（令和4年）
秋季リーグ戦において一部リーグ4度目の優勝を飾る。
神宮大会では決勝戦まで駒を進めるも、明治大学に敗れ惜しくも準優勝。